折叠@ Home EnaScale Supercomuters发现Covid-19治疗的潜在目标

众所周知,一百万志愿者和2.5多个Exaflops,众包分布式计算项目后面的集团表示,它已发现可能的禁止SARS-COV-2病毒的目标。

手保护由病毒细胞包围的地球。[感染/爆发/大流行]
Natali MIS / Getty Images

折叠@ Home Project共享其努力的新结果来模拟来自SARS-COV-2病毒的蛋白质,以更好地了解它们的功能以及如何阻止它们。

折叠@ Home是一种分布式计算工作,当用户的PC空闲时,使用小客户来运行生物医学研究的模拟。客户端独立于彼此操作,以执行自己的独特模拟,并将结果发送到F @ H服务器。(阅读更多关于折叠@ Home Network的信息和管理的更多信息它如何破坏Exaflops障碍。)

在其SARS-COV-2模拟中,F @ H首先瞄准尖峰,锥形阑尾在由三种蛋白质组成的病毒的表面上。尖峰必须打开以将自身附加到人体细胞中以渗透和复制。F @ H的使命是模拟此开放过程,以获得独特的洞察开放状态的样子,并找到一种方法来抑制尖峰和人类细胞之间的连接。

它这样做了。在一个新出版的论文,折叠@首页团队表示,它能够模拟“前所未有的”0.1秒的病毒蛋白质。它们捕获了尖峰综合体的戏剧性开放,以及在其他蛋白质中的形状转移,透露超过50个“隐秘”口袋,扩大了抗病患者设计的靶向选项。

华盛顿大学生物化学副教授Greg Bowman博士和折叠@ Home的领导者表示,通过折叠自身掩盖来保护其受体结合位点,类似乌龟如何拉入其壳体。但最终,他们必须打开潜在主人。

那是针对的f @ h。“我们知道它正在发生,但不是它看起来像。在模拟中,我们看到比实验所看到的更广泛的开场,”鲍曼告诉我。

源自F @ H模拟的模型表明钉子打开并暴露埋地表面。这些表面是感染人细胞所必需的,并且也可以靶向与表面结合的抗体或抗病毒以中和病毒并防止其感染某人。

“通过比任何人都有超过100倍的数据,我们能够捕获像暴露表面的尖峰的戏剧性开口等事件,以其他方式预期是可行的目标。同样,我们也发现了开放的动作在许多其他病毒蛋白中创造新的口袋。所有这些新的结构特征都可能是有用的药物目标。我们在线分享所有数据,以便其他人可以使用它来了解病毒并与我们自己的努力并行地制定抗病毒历,“鲍曼说。

为此,折叠@ home正在参加一个名为的项目covid moonshot.,开放的科学合作,以设计小分子来阻断病毒复制。Covid Moonshot团队正在使用折叠@ HOME通过大型化学品的折叠@ HOME来筛选最有可能是有用的抗病毒药物的化学品,并且这些化学品是由实验合作者进行的合成和测试的。

技术泰坦上升了

在Covid-19之前,折叠@ Home是一个相当温和的项目,拥有30,000名用户和华盛顿大学和其他学校的一些服务器。当大流行袭击和NVIDIA向用户呼吁召唤武器时,该组织突然获得了近百万的用户,其服务器被大量超载。

从那里,科技产业真的加强了帮助。Bowman表示,微软,NVIDIA,AMD,英特尔,AWS,Oracle和Cisco都帮助了硬件和云服务。纯粹的存储捐赠一个petabyte全闪存存储阵列。Linus Tech Tips,一个拥有1200万粉丝的家庭系统建设者的Hobbyist YouTube频道,设置100TB服务器拿走负荷。

“我们非常感谢所有的帮助,”鲍曼说。“大规模突出的公民科学家的支持和技术产业的帮助开辟了我们没有否则的科学机会。”

在它的峰值上,F @ H有超过2.5个exaflops计算,以抛出问题,或2,500个Petaflops。截至10月下旬,已经下降到247 Petaflops.

然而,Bowman看到了它的上行:这比美国最快的超级计算机更快的马力。雷竞技比分

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