轻量级的Linux高性能计算

虽然股票Linux是为桌面和服务器任务进行了优化,简化的版本,可以加快高性能计算系统的节点上的性能。

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其他Linux内存分配函数也被设计为能力,而不是性能。当Linux基于每个段的基础分配内存,它在物理上不连续的。其结果是,内核驱动程序在编程的DMA效率较低,并能证明开销增加和减少的I / O性能。迄今为止,Linux还刚刚开始提供RDMA,这是经常使用的HPC,虽然目前行业的努力在改善这个过程的全面支持。

开发人员还必须确保CNL提供可靠性用户和应用程序的需求。毕竟,在Linux上进行测试当前行业的可靠性主要集中在传统的企业或Web服务器环境 - 而不是在Linux的大型HPC系统的可靠性。Linux是一个复杂的操作系统,需要大量的资源,因此,即使是“修剪回”实施的Linux如CNL将包括更多的互动和显著多行代码不是一个专门的计算节点的操作系统,例如美洲豹。其结果是,运行Linux的HPC计算节点更有可能排出的资源,并有可能用尽它们比传统的Linux环境的不同方式。Cray公司和其他发展中国家CNL必须保证操作系统能够以优雅的方式处理这些情况。

计算节点上实现的Linux

克雷公司已在率先发展和完善CNL的努力,并已与它在高性能计算领域的合作伙伴合作 - 包括美国阿贡国家实验室和其他政府资助的研究人员 - 解决CNL的遗留问题。这项工作正在稳步进行。如今,开发商看到关于雇用CNL,很多的问题上述已经被成功解决系统上运行的许多HPC应用性能良好。CNL开发人员现在正在对大规模收集数据。研究人员正在进行今天在低数千个处理器的测试,但很快就会移动到10000到20000处理器的范围。

克雷认为,这项工作将很快使得即使规模最大的超级计算环境,以受益于这两个系统级和HPC计算节点使用Linux。从长远来看,CNL可以容纳更大的潜力,并且可以提供一个理想的计算节点的操作系统,可以惠及所有用户的HPC。

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卡普兰是目前参与软件设计和开发的技术协调,重点是操作系统,监控系统和硬件接口的系统架构师。他获得学士学位的计算机科学学士学位达特茅斯学院与电气工程修改,并在纽约大学柯朗研究所计算机科学硕士学位。继读研究生,他花了三年时间在并行操作系统的区域BBN先进的计算机工作,然后加入万亿电脑有限公司于1991年,这成为Cray公司于2000年在万亿/克雷,他已经在设计中起到了关键作用和几个克雷系统,包括克雷XT3和MTA /埃尔多拉多,主要是作为一个操作系统工程师开发。

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这个故事,“轻量级Linux的高性能计算”最初发表LinuxWorld-(美国)

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